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BIOPHYTIS : Très intéressant... omicron... AC2E... résistance aux anticorps...

07 déc. 2021 17:48

Omicron, roi des mutations
Comparé à la séquence de référence du SARS-CoV-2, le variant Omicron comporte 44 substitutions d'acides aminés, 6 délétions et une insertion. La protéine S rassemble 29 de ces substitutions, 3 délétions et une insertion. La moitié de ces mutations concerne le receptor binding domain (RBD) qui interagit avec le récepteur ACE2. L'analyse des précédents variants suggère que les mutations du RBD modifient significativement le comportement du coronavirus. Plus précisément, neuf acides aminés semblent accroître les liens entre la protéine S et le récepteur ACE2, et donc sa capacité à infecter les cellules. Le variant Omicron est muté sur quatre d'entre eux : K417N, Q493R, N501Y, et Y505H. La mutation N501Y, observée chez d'autres variants, augmente d'un facteur 9 l'affinité de la protéine S pour ACE2. Combinées, ces mutations laissent penser que le variant Omicron est particulièrement transmissible.

Les autres mutations situées en amont ou en aval du RBD pourraient aussi participer au succès épidémiologique du variant Omicron. Des modifications à proximité du site de coupure des deux sous-unités de la protéine S pourraient renforcer sa résistance aux anticorps neutralisants. La substitution N679K, une des trois identifiées, n'a jamais été observée ailleurs. Au-delà de la protéine S, deux mutations dans la nucléocaspide, la coque protectrice du génome du virus, sont aussi présentes. Elles sont connues pour amplifier la réplication de l'ARN viral et, in fine, la charge virale. « Par conséquent, le variant Omicron a le potentiel de déclencher un nouveau pic épidémique mondial » écrivent les scientifiques du Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology.

5 réponses

  • 07 décembre 2021 18:12

    merci audaubar un éclairage scientifique très interessant
    Esperons que les demandes de BIOPHYTIS vont aboutir

  • 07 décembre 2021 18:16

    Voire aussi le message de jybay : qui ouvre grand la porte à bio101

    Depuis décembre 2019, la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par une infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2), a changé nos vies. Les personnes âgées et celles présentant des comorbidités représentent la grande majorité des patients hospitalisés pour des symptômes graves de COVID-19, notamment le syndrome de maladie respiratoire aiguë et un dysfonctionnement cardiaque. Malgré un énorme effort de la communauté scientifique, des modalités de traitement améliorées limitant la gravité et la mortalité des patients COVID-19 hospitalisés sont toujours nécessaires. Ici, nous comparons l'efficacité des stratégies centrées sur les virus et les patients pour réduire la mortalité due au COVID-19. Nous discutons également des options thérapeutiques qui pourraient réduire davantage les taux de mortalité associés à la maladie à l'avenir. De manière inattendue, un examen approfondi de la littérature suggère que la charge virale du SRAS-CoV-2 ne semble être associée ni à la gravité des symptômes ni à la mortalité des patients hospitalisés atteints de COVID-19. Cela peut expliquer pourquoi, jusqu'à présent, les stratégies centrées sur le virus utilisant des antiviraux visant à inhiber la machinerie réplicative virale n'ont pas réussi à réduire la mortalité due au COVID-19 chez les patients souffrant d'insuffisance respiratoire. En revanche, les traitements anti-inflammatoires sans capacités antivirales mais centrés sur les patients, comme la dexaméthasone ou le Tocilizumab, réduisent la mortalité par COVID-19. Enfin, étant donné que la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 se lie à l'enzyme de conversion 2 de l'angiotensine et inhibe sa fonction, nous explorons les différentes options de traitement en nous concentrant sur le rééquilibrage du système rénine-angiotensine. Cette nouvelle stratégie thérapeutique pourrait, espérons-le, réduire davantage la gravité de l'insuffisance respiratoire et limiter la mortalité due au COVID-19 chez les patients âgés.

  • 07 décembre 2021 18:51

    Je pense sincèrement que je suis sur la bonne valeur, ou sur le bon cheval... Mais je reconnais bien volontiers que c'est long, très long...

  • 07 décembre 2021 20:13

    idem

  • 08 décembre 2021 06:42

    on y croit ca ne devrait plus tarder

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